Поделиться

Российские ученые проверили точность ИИ-моделей для разработки антительных препаратов

Поделиться

фото: Сгенерировать ГигаЧат

Специалисты Центра практического искусственного интеллекта Сбербанка совместно с исследователями Института AIRI разработали SAASBench — открытый инструмент для сопоставления ИИ-моделей, применяемых на ранних этапах создания лекарств на основе антител. Бенчмарк представляет собой набор стандартизированных тестов, позволяющих проверять разные модели в одинаковых условиях.

Как сообщили EastRussia в ПАО Сбербанк, антитела относятся к белкам иммунной системы и способны распознавать определённые молекулы — антигены. Эти свойства используются при создании большого числа современных лекарственных средств, в частности препаратов против онкологических, аутоиммунных и инфекционных заболеваний. Ещё до начала лабораторных испытаний ИИ помогает исследователям отбирать варианты антител, которые выглядят наиболее перспективными для дальнейшей проверки.

Одна из ключевых характеристик такого взаимодействия — аффинность, то есть сила связывания антитела с определённым белком. При разработке препарата, однако, необходимо учитывать и другой параметр — специфичность. Она показывает, способно ли антитело распознать именно требуемый антиген, не вступая во взаимодействие с похожими белками человеческого организма.

Для оценки этого показателя и предназначен SAASBench. В исследовании использовали 20 клинически одобренных антител. Каждой модели для каждого антитела предлагалось шесть потенциальных мишеней: один соответствующий антиген и пять похожих белков человека. От ИИ требовалось определить правильную мишень. В общей сложности исследователи подготовили 120 смоделированных комплексов «антитело — антиген».

С помощью SAASBench учёные проверили пять распространённых вычислительных подходов. Результаты показали, что высокая точность модели при прогнозировании аффинности — то есть способности антитела прочно связываться с антигеном — сама по себе не означает, что модель столь же хорошо определяет нужную мишень среди схожих белков. Таким образом, новый бенчмарк позволяет оценить ещё одну важную сторону работы ИИ при поиске перспективных кандидатов для лекарственных препаратов.

Сергей Рябов, старший управляющий директор, директор по ИИ-трансформации Сбербанка отметил, что при создании SAASBench исследователи хотели проверить вполне практическую задачу: способен ли ИИ среди нескольких близких по свойствам белков определить тот, с которым антитело действительно должно взаимодействовать. По его словам, разработанный инструмент предназначен для сравнения ИИ-моделей на ранних этапах создания антител и не заменяет лабораторные исследования, но позволяет заранее выявлять ненадёжные вычислительные методы. Рябов подчеркнул, что способность антитела связываться с белком и способность распознавать именно нужный белок — разные характеристики. Ошибка модели на раннем этапе может привести к неоправданным затратам команды, тогда как SAASBench помогает обнаружить подобные проблемы ещё до проведения дорогостоящих исследований.

Дмитрий Умеренков, старший научный сотрудник лаборатории «Сильный ИИ в медицине» Института AIRI объяснил, что специфичность характеризует способность антитела взаимодействовать с конкретной мишенью, не связываясь при этом с другими похожими молекулами. По его словам, этот параметр необходимо учитывать при оценке антител, поскольку даже сильное связывание с нужной мишенью не делает препарат пригодным, если молекула одновременно взаимодействует с большим количеством посторонних белков. Это может снижать точность диагностики и эффективность терапии, а также увеличивать вероятность побочных эффектов. Умеренков отметил, что SAASBench позволяет проверять сгенерированные ИИ последовательности антител на специфичность и оценивать, какие существующие инструменты подходят для такой задачи, а от каких лучше отказаться. Такой подход, по его мнению, помогает повысить надёжность оценки, раньше исключать потенциально неспецифичные последовательности и уменьшать количество дорогостоящих лабораторных экспериментов.

Научная работа опубликована в материалах 32-й международной конференции ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD ’26), состоявшейся в Республике Корея. Сам бенчмарк и использованные в исследовании данные доступны в открытом доступе.


Теги:
Новости по теме:
Туры на Дальний Восток от BestArctic.ru erid:pjwvokpoevpk
Больше туров
6+ реклама
ООО «Пресс Код ИТ»
ОГРН 1227700267739, ИНН 9725083184
Картина дня Вся лента
Поделиться
Как дальневосточному бизнесу сохранить устойчивость в эпоху перемен

Удорожание логистики и смена привычных цепочек поставок стали серьезным испытанием для дальневосточных компаний. Чтобы найти эффективные решения для работы в новых условиях, свыше 2,5 тысяч предпринимателей со всего Дальнего Востока собрались на масштабный Бизнес-Фест от Сбера.

Читать полностью
Поделиться
Не внедрил ИИ — потерял бизнес

Искусственный интеллект уже перестал быть игрушкой технологических гигантов — его всё чаще примеряют на себя региональные компании из самых разных отраслей. В Хабаровске Сбер провёл «Акселератор» для местного бизнеса, на котором показал, как генеративный ИИ может сэкономить время, деньги и нервы. Строители, ритейлеры, логисты и айтишники делились опытом и страхами. А спикеры из Сбера объясняли, почему откладывать цифровую трансформацию — всё равно что играть в рулетку с собственной конкурентоспособностью. Разбираемся, что предлагает рынок и зачем это нужно именно сейчас.

Читать полностью
Поделиться
«Государство добавит вам до 360 тысяч»

Программа долгосрочных сбережений с государственным софинансированием уже привлекла миллионы участников — и особенно активно ею пользуются на Дальнем Востоке. Почему все больше людей подключаются к ней онлайн, как получить до 360 тысяч рублей от государства и зачем это может быть выгодно даже тем, кому до пенсии еще далеко — объясняет Светлана Кобелева, директор управления финансовой грамотности и эффективности продаж Дальневосточного банка Сбербанка, в интервью для агентства EastRussia.

Читать полностью
Поделиться
Внешняя торговля России в 2024 году: главные вопросы и возможности дальневосточных предпринимателей

Форум «Экспортный потенциал Приморья» представил лучших экспортеров региона. Мероприятие организовал Центр поддержки экспорта, который входит в краевой центр «Мой бизнес» при поддержке Министерства экономического развития Приморского края. Директор управления продаж малому бизнесу Дальневосточного Сбербанка Инна Войскович рассказала EastRussia о главных итогах участия в форуме.

Читать полностью
Поделиться
То, что рынок прописал

Свыше двух с половиной тысяч средних и крупных предприятий страны сегодня проходят цифровую трансформацию при поддержке Сбера. На территории обслуживания Дальневосточного Сбербанка в процессе цифровизации находится более 100 компаний. Они принадлежат к различным отраслям экономики, а общая картина региональной цифровизации в значительной мере отражает хозяйственную специфику субъектов федерации.

Читать полностью
Поделиться
Ученые из Биробиджана научились разрушать опасный гололед и превращать обычный лед в сверхпрочный материал

Суровый климат требует нестандартных решений. Исследователи НОЦ «АйсТех» разработали экологичную установку для бережной очистки асфальта от толстого наката и одновременно с этим создали уникальный метод армирования, который делает ледовые переправы в пятнадцать раз прочнее.

Читать полностью
Поделиться
Наука стучится, бизнес не открывает: почему инновации ДФО не становятся продуктом

Эффективность высокотехнологичных производств, в том числе в свете распространения креативных отраслей, технологий больших данных и искусственного интеллекта, невозможна без наращивания научного и образовательного потенциала. Но кооперация между наукой и реальным сектором экономики на Дальнем Востоке развита пока слабо.

Впрочем, запрос на проведение научных исследований и опытно-конструкторских разработок растет, поскольку отечественной промышленности все больше приходится опираться на внутренние ресурсы.

Читать полностью
Поделиться
Востоковеды и поворот России на Восток

Во время XIV Всероссийского съезда востоковедов, который прошел во Владивостоке, ведущие ученые этой научной отрасли выступили с лекциями перед студентами ДВФУ. В кооперации с пресс-службой университета EastRussia удалось расспросить доктора исторических наук, заместителя директора по научной работе Института востоковедения РАН (Москва) Валентина Головачева о роли востоковедения в происходящем процессе поворота России на Восток.

Читать полностью
Больше материалов